Я бы попробовал два варианта:
1. Тонкую кожу. Например лайковая перчатка. Плюс обильная густая силиконовая смазка.
По аналогии с велосипедным насосом.
2. Листовой фторопласт толщиной 2-3мм и выточить на токарном станке по размеру цилиндра. Хотя и у первого и второго способа есть свои недостатки: в первом: смазка или запах от неё будет поступать к пациенту, второй: сложнее найти материал, токарные работы, и нужно учитывать, что собранный поршень будет несколько выше и может упереться в крышку тогда нужно уменьшить толщину прижимной шайбы нужно использовать другую или обойтись без неё.